กองทหารบุกฐานของวานรแต่ซีซาร์ยังปล่อยเชลยกลับไปพร้อมข้อความว่าฝูงต้องการสันติ ผู้พันตอบด้วยการโจมตีบ้านของเขาโดยตรง ความสูญเสียทำให้ซีซาร์มอบหมายการอพยพให้ผู้อื่นและออกตามล่าศัตรูด้วยความโกรธ
ระหว่างทางกลุ่มพบเด็กหญิงซึ่งพูดไม่ได้และตั้งชื่อว่าโนวา รวมถึงเบดเอปผู้รอดชีวิตตามลำพัง ทั้งสองทำให้การเดินทางที่เริ่มจากการแก้แค้นกลับเชื่อมกับผลของไวรัสและชีวิตที่สงครามทิ้งไว้ ซีซาร์เริ่มเห็นตนเองคล้ายโคบามากขึ้นทุกครั้งที่ยอมให้ความแค้นนำการตัดสินใจ
ฝูงวานรถูกจับใช้แรงงานสร้างกำแพง ซีซาร์จึงต้องเลิกคิดถึงการลอบสังหารเพียงคนเดียวและวางแผนช่วยทุกชีวิตหนีออกจากค่าย บทบาทผู้นำกลับมามีความหมายเมื่อเขาเลือกความอยู่รอดของชุมชนก่อนความพอใจส่วนตัว
สงครามของมนุษย์สองฝ่ายเปิดทางให้วานรเดินทางสู่ดินแดนใหม่ แต่ซีซาร์ได้รับบาดเจ็บและรู้ว่าหน้าที่ใกล้สิ้นสุด ผู้ชมที่สนใจเรื่องสงครามและการอพยพสามารถเลือกต่อจาก หมวดแอคชั่น ตอนจบจึงให้เขามองเห็นบ้านของฝูงก่อนส่งต่ออนาคตให้คนรุ่นถัดไป
